Desentrañando los Orígenes del SARS-CoV-2: Una Perspectiva Genómica

La pandemia de COVID-19 sigue siendo una amenaza formidable para la salud pública global y ha trastornado economías worldwide. El SARS-CoV-2, el virus responsable del brote, no es una cepa de gripe típica; ataca tanto el tracto respiratorio superior como inferior, deteriorando procesos respiratorios esenciales y causando mortalidad significativa. Al 6 de abril de 2020, Worldometer reportaba 1.337.166 casos confirmados y 74.176 muertes globalmente.

Analizar el genoma del SARS-CoV-2 proporciona insights críticos sobre el origen del virus, informa desarrollo diagnóstico y guía innovación terapéutica para reducir pérdida de vidas.

Entendiendo el Genoma del SARS-CoV-2

El SARS-CoV-2 es un virus de ARN monocatenario con un genoma de casi 30 kilobases y 12 marcos de lectura abiertos putativos. Investigadores chinos secuenciaron primero el genoma en diciembre 2019, y múltiples equipos han liberado desde entonces secuencias completas, ahora públicamente disponibles en GenBank y la Base de Datos de Coronavirus.

Origen del Virus SARS-CoV-2

Las teorías de conspiración a menudo surgen durante brotes, fomentando prejuicios contra naciones, culturas y comunidades. Un enfoque riguroso basado en evidencia es esencial para contrarrestar la desinformación. Los análisis genómicos muestran inequívocamente que el SARS-CoV-2 evolucionó naturalmente y no es un constructo de laboratorio.^1,2 Más de 100 cepas muestreadas worldwide son más de 99,5 % idénticas a nivel nucleotídico, indicando mutación regional mínima y alta transmisibilidad.

Coronavirus previos —SARS-CoV (2002, China) y MERS-CoV (2012, Arabia Saudita)— se rastrearon a murciélagos. La secuenciación del coronavirus de murciélago RaTG13 reveló 96,2 % de identidad con SARS-CoV-2, confirmando origen zoonótico. Adicionalmente, 91 % de similitud genómica con coronavirus de pangolín malayo sugiere que los pangolines pueden haber servido como huésped intermedio. Los pangolines, valorados en Asia para medicina tradicional y como manjares, son el mamífero más traficado mundialmente.

El SARS-CoV-2 difiere de otros coronavirus por poseer 88 % o menos identidad de secuencia. Análisis filogenéticos colocan al SARS-CoV-2, RaTG13 y CoV de pangolín dentro de un nuevo clado de beta-coronavirus, como se ilustra abajo.

¿Cómo Ingresa el Coronavirus al Huésped?

La proteína de pico (S) es una máquina molecular multifuncional compuesta de dos subunidades, S1 y S2. S1 une el receptor huésped, mientras S2 media fusión de membrana. El dominio de unión al receptor (RBD), de 193 aminoácidos, se une al receptor humano ACE2 —expresado en células pulmonares, arteriales, cardíacas, renales e intestinales. ACE2 normalmente regula presión arterial convirtiendo angiotensina II a angiotensina 1-7 pero también sirve como punto de entrada viral.

El CoV de pangolín y SARS-CoV-2 comparten secuencias RBD altamente conservadas, incluyendo residuos clave de unión idénticos (LFQSNY). En contraste, el RBD del SARS-CoV-2 de murciélago difiere en 17 residuos, incluyendo cinco sitios críticos de unión, sugiriendo interacción limitada con ACE2 sin confirmación experimental.

La proteína de pico también contiene un sitio de escisión furina en el límite S1/S2, denotado PRRARSV, reconocido por la proteasa FURIN del huésped. La adquisición de este motivo puede representar un evento 'ganancia de función' que permitió al virus infectar eficientemente células humanas. Apuntar a este sitio de escisión podría ofrecer una estrategia terapéutica para bloquear entrada viral.

En general, el RBD optimizado de la proteína de pico, motivo de escisión furina y fuerte afinidad por ACE2 sugieren selección natural y eventos de recombinación entre coronavirus de murciélago y pangolín. Estos hallazgos apoyan un origen zoonótico generado por recombinación natural en lugar de manipulación de laboratorio.

Donante Inmediato del SARS-CoV-2 a Humanos

El genoma del SARS-CoV-2 exhibe un mosaico de secuencias de murciélago RaTG13 y CoV de pangolín, consistente con recombinación. Identificar el huésped intermedio preciso —ya sea otra especie de pangolín o una especie de vida silvestre diferente presente en el mercado de mariscos de Wuhan— permanece una pregunta abierta. Clarificar el origen es crucial para prevenir futuros eventos de salto de especie y pandemias globales.

Para más información, contáctenos en https://www.3dsbiovia.com/about/contact/.